本署轄區為福建省連江縣，本署檢察業務受福建高等檢察署金門檢察分署、最高檢察署指揮監督；行政業務直屬法務部監督。
連江縣有南竿鄉、北竿鄉、莒光鄉(東莒、西莒)、東引鄉，合計四個鄉。總面積29.6平方公里。人口數約九千多人。
