福建連江地方檢察署

本縣地處荒陬，與內陸隔絕，本無所謂縣治司法制度之設立，迨及民國三十八年(1949)，大陸淪陷，政府退守台澎，本縣諸列島逐成為駐防之軍事重地。民國四十五年，本島所轄一切政務悉歸馬祖守備區指揮部管轄，而司法業務，由軍事審判機關受理。民國四十五年七月本地區成立政務委員會，唯未設司法或軍法機關，民事訴訟案件仍委託馬祖守備區指揮部軍法組代審。嗣為期速審速結，以確保人民權益，並安定社會，乃於縣政府設立軍法室，以軍法兼理司法之方式，試行辦理本縣民事案件及刑事案件。
馬祖地區原無司法機關之設立，民國五十八年(1969)間福建金門地方法院在馬祖設立連江民事庭，專辦民事訴訟案件之業務，至於刑事案件，則由連江縣政府軍法室偵審，為配合台、澎地區解除戒嚴，經行政院核定於民國七十六年十月十日成立連江檢察官辦公室，屬(福建金門地方法院檢察署)，並暫借福建金門地方法院連江庭二樓辦公，掌理刑事偵查，執行等業務，轄區包括南竿鄉、北竿鄉、莒光鄉、東引鄉。嗣有司法院、法務部核撥經費委由兵工協建聯合司法辦公大樓，費時三載完工，並於八十年遷入司法辦公大樓辦公，加強戰地法治建設，確保人民權益，建立完整之司法體制，九十二年法務部特別動用第一預備金整修辦公室環境，並於九十二年十二月三十一日正式成立福建連江地方法院檢察署。
檢察機關自107年5月25日起去法院化後更名為福建連江地方檢察署。