隸屬於金門地檢署的連江檢察官辦公室,即將在年底前籌備成立「福建連江地方法院檢察署」,預定明年一月一日揭牌成立。連江縣是全國廿三縣市中唯一沒有設地檢署的縣市,過去馬祖地區刑事案,原由連江縣政府設立「軍法室」辦理,民國七十六年配合解嚴,在七十六年十月十日成立「連江檢察官辦公室」,隸屬於金門地檢署,負責馬祖地區刑事案件偵查及執行業務。